Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATRXP46100 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATRXP46100 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRXP46100 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRXP46100 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms