Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP5P45974 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP5P45974 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP5P45974 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
USP5P45974 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP5P45974 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP5P45974 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
USP5P45974 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP5P45974 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP5P45974 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP5P45974 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP5P45974 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP5P45974 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP5P45974 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms