Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC5P40937 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC5P40937 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC5P40937 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC5P40937 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC5P40937 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC5P40937 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC5P40937 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC5P40937 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms