Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNB1P35222 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNB1P35222 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNB1P35222 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNB1P35222 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNB1P35222 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms