Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA11P31270 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms