Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5DP30049 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms