Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms