Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB2P29033 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB2P29033 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms