Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms