Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLNP26678 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PLNP26678 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLNP26678 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLNP26678 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms