Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSSP25774 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms