Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B4P23634 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms