Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCSHP23434 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSHP23434 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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