Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX1P22670 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX1P22670 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX1P22670 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFX1P22670 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFX1P22670 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX1P22670 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX1P22670 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX1P22670 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX1P22670 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms