Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms