Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF3P18847 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF3P18847 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATF3P18847 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATF3P18847 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF3P18847 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF3P18847 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF3P18847 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF3P18847 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF3P18847 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF3P18847 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF3P18847 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF3P18847 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF3P18847 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF3P18847 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms