Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPI1P17947 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPI1P17947 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPI1P17947 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPI1P17947 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPI1P17947 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPI1P17947 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms