Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCSHP14314 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCSHP14314 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms