Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms