Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH1P12830 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH1P12830 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH1P12830 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH1P12830 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH1P12830 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDH1P12830 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDH1P12830 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH1P12830 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH1P12830 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH1P12830 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms