Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms