Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms