Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CT47B1P0C2W7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms