Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLA1P09884 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLA1P09884 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLA1P09884 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLA1P09884 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLA1P09884 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLA1P09884 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLA1P09884 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLA1P09884 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLA1P09884 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLA1P09884 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLA1P09884 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLA1P09884 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLA1P09884 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLA1P09884 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLA1P09884 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLA1P09884 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLA1P09884 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLA1P09884 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLA1P09884 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLA1P09884 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
POLA1P09884 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
POLA1P09884 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
POLA1P09884 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
POLA1P09884 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
POLA1P09884 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
POLA1P09884 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
POLA1P09884 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
POLA1P09884 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLA1P09884 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLA1P09884 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLA1P09884 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLA1P09884 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLA1P09884 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLA1P09884 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLA1P09884 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLA1P09884 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLA1P09884 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
POLA1P09884 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLA1P09884 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLA1P09884 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLA1P09884 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLA1P09884 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLA1P09884 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms