Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIL1P09327 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIL1P09327 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIL1P09327 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIL1P09327 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VIL1P09327 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VIL1P09327 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIL1P09327 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIL1P09327 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VIL1P09327 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIL1P09327 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms