Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP10P09238 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP10P09238 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP10P09238 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP10P09238 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP10P09238 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP10P09238 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP10P09238 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP10P09238 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP10P09238 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP10P09238 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP10P09238 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP10P09238 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms