Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM2P07951 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM2P07951 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM2P07951 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms