Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF1RP07333 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms