Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3DP05423 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms