Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCNP04198 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCNP04198 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms