Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POP4O95707 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POP4O95707 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POP4O95707 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POP4O95707 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms