Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL3O95236 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL3O95236 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL3O95236 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL3O95236 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL3O95236 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL3O95236 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms