Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms