Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4AO75164 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms