Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms