Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ABCC9O60706 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms