Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms