Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNMO15061 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNMO15061 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNMO15061 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNMO15061 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNMO15061 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNMO15061 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNMO15061 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNMO15061 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNMO15061 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNMO15061 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNMO15061 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNMO15061 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNMO15061 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNMO15061 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNMO15061 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNMO15061 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNMO15061 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYNMO15061 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SYNMO15061 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYNMO15061 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNMO15061 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms