Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF646O15015 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF646O15015 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms