Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IKBKBO14920 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms