Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3KT08 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3KT08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
J3KT08 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms