Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DEV8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DEV8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DEV8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms