Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms