Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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