Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms