Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIPSLA2A3N6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms