Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms