Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 COL21A1-201ENST00000244728 4339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 PPFIA2-216ENST00000549396 5363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 IQCH-AS1-203ENST00000559298 5753 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 NFKB1-212ENST00000600343 4010 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 NEPRO-202ENST00000383675 4672 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PCYT1B-203ENST00000379145 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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