Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-8P-201ENST00000384328 165 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073475.1-201ENST00000434012 592 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002480.1-201ENST00000442252 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf147-203ENST00000460965 446 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL420P-201ENST00000463843 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073861.1-201ENST00000496294 459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093821.1-201ENST00000503950 539 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011379.2-201ENST00000523154 583 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYAB-215ENST00000533971 981 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MS4A12-205ENST00000537076 1019 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDFIP1P1-201ENST00000543144 525 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117372.1-201ENST00000548633 620 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP19A1-210ENST00000557858 832 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM69-210ENST00000561043 1017 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087761.1-201ENST00000568836 556 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084876.1-201ENST00000612793 641 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027139.2-201ENST00000615639 448 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513327.1-208ENST00000624012 1047 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf137-201ENST00000624685 386 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPK1-214ENST00000639328 826 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01800-201ENST00000445865 1977 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11A-209ENST00000569896 1396 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC5-218ENST00000541887 2400 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007424.1-201ENST00000552582 1641 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTZ1-203ENST00000361389 1010 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131097.2-201ENST00000404031 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01241-201ENST00000423326 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms