Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC099560.1-201ENST00000412811 500 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TRIM43CP-201ENST00000422468 1028 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL357037.1-201ENST00000454758 322 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 C4orf22-205ENST00000508675 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC016954.1-201ENST00000549976 745 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC055716.1-201ENST00000550077 495 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AF146191.1-201ENST00000604941 889 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC243772.3-202ENST00000609662 1148 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 GSTTP1-204ENST00000621179 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC241585.4-201ENST00000640951 686 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 HAVCR1-205ENST00000523175 1449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LINC02282-201ENST00000535153 1655 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RN7SKP119-201ENST00000410753 273 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 ATP13A4-AS1-201ENST00000426459 795 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 LINC01865-202ENST00000436808 853 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMEM225BP0DP42 GGT3P-203ENST00000445651 368 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms